การศึกษาเปรียบเทียบประสิทธิภาพของชุดน้ำยาสำเร็จรูป 3 ชนิด สำหรับการตรวจหาเชื้อไวรัส อหิวาต์สุกร ด้วยวิธี Real-Time RT-PCR
คำสำคัญ:
ไวรัสอหิวาต์สุกร, real-time RT-PCR, copies/µL, ค่าประสิทธิภาพของปฏิกิริยา, ค่า R2บทคัดย่อ
การศึกษาเปรียบเทียบประสิทธิภาพของชุดน้ำยาสำเร็จรูป 3 ชนิด สำหรับการตรวจหาเชื้อไวรัสอหิวาต์สุกร ด้วยวิธี real-time RT-PCR จากตัวอย่างเจือจางแบบ 10-fold (10 เท่า) ซึ่งเป็นสารพันธุกรรมที่สกัดจากพลาสมิดของเชื้อไวรัสอหิวาต์สุกร ทำการทดลองทั้งหมด 3 ครั้ง โดยเปลี่ยนชุดน้ำยาสำเร็จรูป แต่ใช้โพรบและไพรเมอร์ที่ความเข้มข้นเท่ากัน ใช้สารพันธุกรรมตั้งต้นปริมาตรเท่ากัน และจำนวนรอบการทำ real-time RT-PCR 45 รอบเท่ากัน พบว่า ชุดน้ำยาสำเร็จรูป TaqMan® Fast Virus 1-Step Master Mix สามารถตรวจพลาสมิดเจือจางของเชื้อไวรัสอหิวาต์สุกรที่ความเข้มข้นต่ำสุด คือ 7.923 copies/µL ได้ และตรวจวัดได้รวดเร็วด้วยจำนวนรอบที่น้อยกว่าชุดน้ำยาสำเร็จรูป SuperScriptTM III PlatinumTM One-Step qRT-PCR Kit และ QuantiTect® Probe RT-PCR Kit ที่ระดับความเข้มข้นเดียวกัน ค่าประสิทธิภาพของปฏิกิริยา PCR efficiency (E) และค่า R2 อยู่ในช่วงที่เหมาะสม จากผลการวิจัย คณะผู้วิจัยจึงเลือกชุดน้ำยาสำเร็จรูป TaqMan® Fast Virus 1-Step Master Mix สำหรับใช้ในการตรวจหาเชื้ออหิวาต์สุกร (Classical Swine Fever) ด้วยวิธี real-time RT-PCR กับเครื่องเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมในสภาพจริง รุ่น QuantStudio™ 5
เอกสารอ้างอิง
วีระพงศ์ ลุลิตานนท์. (2557). เทคนิคเรียลไทม์พีซีอาร์ Real-time PCR (พิมพ์ครั้งที่ 1). กรุงเทพมหานคร: บริษัท ดีทรีโอ จำกัด.
Risatti, G. R., Callahan, J. D., Nelson, W. M., & Borca, M. V. (2003). Rapid detection of classical swine fever virus by a portable real-time reverse transcriptase PCR assay. Journal of Clinical Microbiology, 41(1), 500-505.
Rogers-Broadway, K. R., & Karteris, E. (2015). Amplification efficiency and thermal stability of qPCR instrumentation: Current landscape and future perspectives. Experimental and Therapeutic Medicine, 10(4), 1261-1264.
Vilcek, S., Herring, A. J., Herring, J. A., Nettleton, P. F., Lowings, J. P., & Paton, D. J. (1994). Pestiviruses isolated from pigs, cattle and sheep can be allocated into at least three genogroups using polymerase chain reaction and restriction endonuclease analysis. Archives of Virology, 136(3-4), 309-323.
Whelan, J. A., Russell, N. B., & Whelan, M. A. (2003). A method for the absolute quantification of cDNA using real-time PCR. Journal of Immunological Methods, 278(1), 261-269.
ดาวน์โหลด
เผยแพร่แล้ว
รูปแบบการอ้างอิง
ฉบับ
ประเภทบทความ
หมวดหมู่
สัญญาอนุญาต
ลิขสิทธิ์ (c) 2025 วารสารวิชาการ ปขมท.
อนุญาตภายใต้เงื่อนไข Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
